A legújabb, kladisztikus, rendszertan elveti a rendszertani kategóriákat, azaz nincsenek benne domének, országok, törzsek, stb. Így is elég nehéz meghúzni, hogy hol van az ország és a törzs, stb. kategóriák között a határvonal. Egy ilyen szemléletű rendszer található pl. Adl et. al. 2012. The revised classification of Eukaryotes. Journal of Eukaryotic Microbiology, 59:429-514 cikkében.
Az Eukarióták rendszere alapvetően az Eozoa (ez lényegében lefedi az Excavatat) - Podiates - Corticates három fő csoportot különbözteti meg. Ezek az itt országként említettek feletti kategória.
A következő kérdés, hogy ha az állatokat (Metazoa), a növényeket (Viridiplantae v. Plantae) és a gombákat (Fungi) országnak tartjuk, akkor minek tartsuk a magasabb kategóriákat, mint az állatokat, gombákat, gallérosostorosokat, stb. magába foglaló Opisthokonta csoportot, vagy az elsődleges plasztisszal rendelkező Archaeplastida csoportot.
Cavalier-Smith még 2014-es publikációkban (Cavalier-Smith, T., Chao, E. E., Snell, E. A., Berney, C., Fiore-Donno, A. M. és Lewis, R. 2014. Multigene eukaryote phylogeny reveals the likely protozoan ancestors of opisthokonts (animals, fungi, choanozoans) and Amoebozoa. Molecular Phylogenetics and Evolution 81(0): 71-85) is csak kevés országot különböztet meg, de ezek viszont messze nem fedik le a teljes eukarióta diverzitást.
